Koronaviruset janë një grup virusesh ARN që shkaktojnë sëmundje tek gjitarët dhe zogjtë. Tek njerëzit dhe zogjtë, ato shkaktojnë infeksione të traktit respirator (të frymëshkëmbimit) që mund të variojnë nga të lehta deri në vdekjeprurëse. Sëmundjet e lehta respiratore tek njerëzit nënkuptojnë raste të ftohjes së zakonshme (e cila shkaktohet edhe nga viruse të tjerë, kryesisht rhinoviruse), ndërsa variantet më vdekjeprurëse mund të shkaktojnë SARS, MERS dhe COVID-19. Tek lopët dhe derrat koronaviruset shkaktojnë diarre, ndërsa tek minjtë shkaktojnë hepatit dhe encefalomielit. Ende nuk ka vaksina ose medikamente antivirale për të parandaluar ose trajtuar infeksionet njerëzore të koronaviruseve.

Koronaviruset i takojnë nënfamiljes Orthocoronavirinae, që është pjesë e familjes Coronaviridae, e rendit Nidovirales dhe mbretërisë Riboviria. Ato janë viruse të mbështjellë me një gjenomë ARN dhe kanë thumba karakteristike në formë shkopi që projektohen nga sipërfaqja e tyre, të cilat në mikrografitë elektronike krijojnë një imazh që të kujton koronën diellore, nga e cila rrjedh edhe emri i tyre.

Etimologjia

Emri "koronavirus" rrjedh nga termi latin "corona", që do të thotë "kurorë", një huazim nga greqishtja ky i termit "κορώνη". Emri u shpik nga June Almeida dhe David Tyrrell, të cilët ishin të parët që vëzhguan dhe studiuan koronaviruset njerëzorë. Termi u përdor për herë të parë në shtyp në vitin 1968 nga një grup jozyrtar i virologëve në revistën Nature, për të përcaktuar familjen e re të viruseve. Ai i referohet pamjes karakteristike të formës infektive të virusit me anë të mikroskopisë elektronike, të cilët kanë një skaj të projeksioneve të sipërfaqes me gunga, duke krijuar një imazh që të kujton kurorën diellore. Kjo morfologji krijohet nga peplomerët me thumba viralë, të cilat janë proteina në sipërfaqen e virusit.

Emri shkencor Coronavirus u pranua si emër i gjinisë nga Komiteti Ndërkombëtar për Nomenklaturën e Virusëve (më vonë u quajt Komiteti Ndërkombëtar për Taksonominë e Viruseve) në vitin 1971. Ndërsa numri i specieve të reja u rrit, në vitin 2009 gjinia u nda në katër gjini: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Deltacoronavirus dhe Gammacoronavirus. Emri i zakonshëm koronavirus përdoret për t'iu referuar çdo anëtari të nënfamiljes Orthocoronavirinae. Që nga viti 2020, njihen zyrtarisht 45 specie.

Historia e Koronaviruseve

Raportet më të hershme të një infeksioni nga koronaviruset në kafshë datojnë në fund të viteve 1920, kur në Amerikën e Veriut u shfaq një infeksion akut i frymëmarrjes tek pulat e zbutura. Në vitin 1931 Arthur Schalk dhe M.C. Hawn paraqiti raportin e parë të detajuar, i cili përshkroi një infeksion të ri të frymëmarrjes tek pulat në Dakotën e Veriut. Infeksioni i pulave të porsalindura u karakterizua nga vështirësi në frymëmarrje, me shkallë të lartë të vdekshmërisë prej 40-90%. Në vitin 1933 Leland David Bushnell dhe Carl Alfred Brandly izoluan virusin që shkaktoi infeksionin. Virusi atëherë njihej si virusi i bronkitit infektiv (IBV). Në vitin 1937 Charles D. Hudson dhe Fred Robert Beaudette e kultivuan virusin për herë të parë. Mostra filloi të njihej si lloji Beaudette. Në fund të viteve 1940, u zbuluan dy koronavirusë të tjerë kafshësh, JHM që shkakton sëmundje të trurit (encefalit) dhe virusi i hepatitit të miut (MHV) që shkakton hepatit tek minjtë. Në atë kohë nuk ishte kuptuar ende që këto tre viruse të ndryshme kishin lidhje midis tyre.

Koronavirusët njerëzorë u zbuluan në vitet 1960, duke përdorur dy metoda të ndryshme në Mbretërinë e Bashkuar dhe Shtetet e Bashkuara. Në vitin 1961, Kendall, Malcolm Bynoe dhe David Tyrrell kultivuan një virus unik të ftohjes së zakonshme të emërtuar B814. Virusi nuk mund të kultivohej duke përdorur teknika standarde të cilat kishin kultivuar me sukses rinoviruset, adenoviruset dhe viruse të tjera të zakonshme të ftohjes. Në vitin 1965, Tyrrell dhe Bynoe kultivuan me sukses virusin e ri duke e kaluar serikisht nëpër kulturën e organeve të trakës embrionale njerëzore. Metoda e re e kultivimit u prezantua në laborator nga Bertil Hoorn. Virusi i izoluar kur u fut përmes hundës tek vullnetarët shkaktoi një ftohje dhe u çaktivizua nga eteri, që tregonte se kishte një shtresë mbështjellëse yndyrore. Në vitin 1962, Dorothy Hamre dhe John Procknow në Universitetin e Çikagos izoluan një ftohje të re tek studentët e mjekësisë. Ata izoluan dhe rritën virusin në kulturën e indeve të veshkave, duke e emërtuar atë 229E. Virusi i ri shkaktoi një ftohje tek vullnetarët dhe u çaktivizua nga eteri në mënyrë të ngjashme si B814.

Transmetimi

Njerëzit ose kafshët e infektuara janë në gjendje ta hedhin virusin në mjedis. Koronaviruset synojnë kryesisht qelizat epiteliale. Ata transmetohen nga një mikpritës në një mikpritës tjetër, në varësi të specieve të koronavirusit, ose nëpërmjet aerozolit, sendeve, veshjeve dhe ushqimeve të infektuara, ose rrugës fekal-orale (duarve të ndotura me materiale të jashtëqitura). 

Koronaviruset njerëzorë infektojnë qelizat epiteliale të traktit respirator (të frymëshkëmbimit), ndërsa koronaviruset shtazore zakonisht infektojnë qelizat epiteliale të traktit tretës. Koronavirusi SARS, për shembull, përmes spërklave infekton qelizat epiteliale njerëzore të mushkërive, duke u lidhur me receptorin e enzimës konvertuese të angiotenzinës 2. Gastroenteriti i transmetueshëm nga koronavirusi (TGEV) infekton, përmes rrugës fekale-orale qelizat epiteliale të traktit tretës të derrit, duke u lidhur me receptorin e alaninë aminopeptidazës.

Klasifikimi

Pema filogjenetike e koronaviruseve

Koronaviruset formojnë nënfamiljen Orthocoronavirinae, e cila është një nga dy nën-familjet në familjen Coronaviridae, rendin Nidovirales dhe mbretërinë Riboviria. Ato ndahen në katër gjini: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus dhe Deltacoronavirus. Koronaviruset alfa dhe beta infektojnë gjitarët, ndërsa ato gama dhe delta infektojne kryesisht zogjtë.

Për sa i takon rrezikshmërisë, koronaviruset ndryshojnë ndjeshëm nga njëri-tjetri. Disa mund të vrasin më shumë se 30% të të infektuarve, siç është MERS-CoV, dhe disa janë relativisht të padëmshëm, vetëm me ftohje të zakonshme. Koronaviruset mund të shkaktojnë ftohje me simptoma kryesore, të tilla si ethe dhe dhimbje fyti nga fryrja e bajameve (tonsilave). Koronaviruset mund të shkaktojnë pneumoni (pneumoni virale direkte ose pneumoni bakteriale dytësore) dhe bronkit (bronkit viral direkt ose bronkit bakterial dytësor). Koronavirusi njerëzor i zbuluar në 2003, SARS-CoV, i cili shkakton sindromën e rëndë akute të frymëmarrjes (SARS), ka një patogjenezë unike sepse shkakton infeksione të traktit të sipërm dhe të traktit të poshtëm të frymëshkëmbimit (respirator).

Sëmundja Coronavirus 2019 (COVID-19)

Në Dhjetor 2019, në Wuhan - Kinë u raportua një shpërthim i pneumonisë, lidhur me të cilën në 31 Dhjetor 2019 u gjurmua një tip i ri i koronavirusit. Nga Organizata Botërore e Shëndetësisë (OBSH), fillimisht këtij koronavirusi iu dha emri i përkohshëm 2019-nCoV. Më vonë, Komiteti Ndërkombëtar për Taksonominë e Virusëve e quajti SARS-CoV-2.

Që nga 25 shtatori 2020, në pandeminë COVID-19 ka pasur të paktën 981.808 vdekje të konfirmuara dhe më shumë se 32.141.225 raste të konfirmuara të infektuara. Tipi Wuhan është identifikuar si një lloj i ri i Betacoronavirusit nga grupi 2B, me afërsisht 70% ngjashmëri gjenetike me SARS-CoV. Virusi ka një ngjashmëri 96% me një koronavirus të lakuriqit të natës, kështu që dyshohet gjerësisht se buron edhe nga lakuriqët e natës. Pandemia ka shkaktuar kufizime të udhëtimeve dhe bllokime ndërkombëtare në shumë vende.

Parandalimi dhe trajtimi

Nuk ka vaksina ose ilaçe antivirale për të parandaluar ose trajtuar infeksionet njerëzore të koronavirusit. Trajtimi është vetëm mbështetës. Janë identifikuar një sërë molekulash antivirale, si proteaza virale, polimeraza dhe proteina hyrëse, për të cilat po zhvillohen medikamente, të cilat synojnë të ndërhyjnë pikërisht në këto proteina dhe në hapat e ndryshëm të replikimit viral. Gjithashtu, në zhvillim e sipër janë edhe një numër vaksinash të mundshme për koronaviruset e ndryshme njerëzorë. 

Nuk ka ende medikamente antivirale të disponueshëm për të trajtuar koronaviruset e kafshëve. Edhe për disa tipe që kanë vaksina të disponueshme (si IBV - i pulave, TGEV - i derrave dhe Canine CoV - i qenve), efektiviteti i tyre është i kufizuar. Në rastin e shpërthimeve të koronaviruseve tepër ngjitëse të kafshëve, të tilla si PEDV, për të parandaluar transmetimin në tufa të tjera, mund të aplikohen masa të tilla si shkatërrimi i tufave të tëra të derrave.